日本认可中国的本科吗？
我来说一下日本的硕士学位的情况吧，因为本人是工科大学硕士，所以对文科不是很了解。 日本的学位一共分4个等级：学士、准学士（没有这个称呼，相当于本科未毕业）、修士（硕士）、博士 获得学士学位后就可以考修士了，一般2年，文科3年，理科5年。
修士考试通过之后就是修士课程的学习，然后最后考试答辩通过后就发修士的学位了。不过有些学校会把研究生（旁听生）和修士的课程一起上，这个根据学校的安排来定。 有的专业有学分制，比如经济学，工学等，只要是修满规定的学分就可以申请毕业。但是有些专业是没有学分的，比如哲学，需要学完规定的课程才可以申请毕业。
关于毕业的考试每个学校的制度不是完全一样的。有的是论文加笔试加面试，有的是只有面试或者只有笔试。具体要看学校的制度。 关于你的第二问题，从理论上说只要你能拿到日本大学的硕士学位，再申请一个美国的博士学位应该是可以的。因为美国大学是承认日本的大学学历的（除了个别军校之类的特殊院校）。
但实际中有没有人去那么做呢？我觉得比较少。一个是签证的问题，另一个是学术上的问题。首先你在日本拿到的硕士学位和美国拿到的硕士学位在学历上是有不同标注的，会注明你是哪所大学的哪个专业毕业，另外还会有你毕业时间的记录。
我想如果你是想去好的大学读博的话，对方肯定会考虑让你先读他们的硕士再说。而如果你只是为了弄到一个硕士学位而已，那完全没有必要再去日本留学了，因为美国的硕士门槛要低一些，而且学术氛围要比日本好很多。